酵母双杂交表明拟南芥AtBT2蛋白可以与AtRGA互作。与对照相比,拟南芥bt1/2双突变体幼苗高度降低,而硝酸盐处理可以进一步抑制其生长,外源施加GA可以回复其生长缺陷。在拟南芥中异源表达MdBT2可以明显提高植株高度,而PAC处理则会抑制这种生长的促进作用。在拟南芥中异源表达MdRGL3a可以明显抑制植株生长,而硝酸盐处理和MdBT2过表达则会缓解这种生长抑制作用。外源GA处理可以逆转以上对植株生长的影响(图A-D)。以上结果表明,BT蛋白通过DELLA蛋白调控植株生长,这一机制在不同的植物中具有保守性。酵母文库构建的目的酵母的做法。酵母文库价格
酵母双杂交文库:为研究松树生长时相转变和生殖发育的奥秘,本研究收集了油松 7 个年龄段的叶片进行了转录组测序。加权基因共表达网络分析(WGCNA)鉴定到一个与年龄***相关的基因模块(图 A)。按照表达模式,可以分为 2 个子模块:随年龄增长而表达上升的基因子模块、随年龄增长而表达降低的基因子模块(图 B-D)。这些基因在 5-7 年营养生长至生殖生长过渡期发生了一个明显的表达模式转变,表明在生殖发育启动阶段存在一个相对剧烈的时相转变过程。酵母文库价格酵母文库构建方法酵母筛库构建酵母文库的意义。
酵母双杂交、pulldown和BiFC实验均显示,MdTRB1可以通过其C末端与JAZ1蛋白互作。在苹果叶片和愈伤组织中过表达MdJAZ1,花青素和原花青素的累积受到明显抑制。在苹果叶片和愈伤组织***表达MdJAZ1/MdJAZ1,结果显示过表达MdJAZ1抑制了MdTRB1对花青素和原花青素累积的促进作用。Pull down 实验和荧光素酶互补成像实验结果表明,在 MdJAZ1 存在下,MdTRB1 与 MdMYB9 的结合减弱(图 a-c);外源施加 JA 可以部分恢复 MdTRB1 与 MdMYB9 的结合。对于 MdTRB1 在 JA 介导的花青素和原花青素积累中的作用机制,本研究建立了一个新的模型:MdTRB1 通过与 MdMYB9 互作,增强了 MdMYB9 对下游基因的转录***活性,进而正向调节了 JA 介导的花青素和原花青素累积。在 JA 缺乏的条件下,MdJAZ1 与 MdTRB1 互作,干扰了 MdTRB1 与 MdMYB9 之间的结合;在 JA 存在的条件下,MdJAZ1 被降解,MdTRB1 被释放出来以参与后续过程。
利用酵母文库进行双杂交筛选,结果显示 MdBT2 可以与 MdRGL3a 结合。MdRGL3a 编码 GA 信号阻遏物 DELLA 蛋白,主要分布于细胞核中。MdRGL3a 对于 GA 处理非常敏感,可以引起其发生降解,PAC 处理可以提高其稳定性。进一步的酵母一对一杂交验证实验表明,两者的结合依赖于 MdBT2 的 BTB 和 BACK 结构域、MdRGL3a 的 LHRI 和 SAW motif(图 A-B)。并通过 GST pull-down、BiFC 实验也证实了 MdBT2与 MdRGL3a 的结合(图 C-D)。细胞外降解实验显示,与对照相比,MdRGL3a 与过表达 MdBT2 的愈伤组织的总蛋白共同孵育,会导致 MdRGL3a 的降解加快;而与抑制 MdBT2 表达的愈伤组织的总蛋白共同孵育,会导致 MdRGL3a 的降解减缓(图 A)。并且蛋白酶体抑制剂 MG132 可以***抑制 MdRGL3a 的降解(图 B)。改变 MdRGL3a 表达量并不影响 MdBT2 的降解。以上结果表明,MdRGL3a 可能通过 26S 蛋白酶体途径发生降解,而 MdBT2 可以抑制 MdRGL3a 的降解。欧易生物酵母文库项目发表 Science 封面文章欧易生物。
酵母单杂交结果显示,磷酸盐饥饿响应因子OsPHR1/2/3可以***51个目标启动子中的25个,包括OsRAM1、OsRAD1、OsWRI5A等。OsRAM1、OsRAD1、OsWRI5A自身又可以调控许多菌根共生相关基因的表达(图A)。对丛枝菌根共生响应基因启动子序列预测分析显示,有78个转录因子被富集,87%的菌根共生响应基因受到OsPHR1/2/3的调控,其中42%受到OsPHR1/2/3的直接调控。因此推测OsPHR1/2/3可能是菌根共生调控网络中的一个关键调控枢纽(图A-B)。EMSA和荧光素酶报告实验证实,OsPHR12可以直接结合并***OsRAM1、OsWRI5A、OsPT11、OsAMT3启动子序列(图C-F),并且这种结合依赖于启动子中的P1BS元件(图G)。传统酵母杂交技术应用已经30多年,技术已经成熟稳定。酵母文库价格
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小欧从2018年即开始关注酵母杂交与高通量测序相结合的技术发展,如2017年CaoGang老师等发表的RLL-Y2H技术,实现了文库筛文库可能,该技术通过对酵母双杂常用载体的改造,并结合高通量测序,可直接获得AD-BD互作蛋白对。所用方法相当巧妙,感兴趣的同学请点击《当酵母双杂交遇到高通量测序》。钮老师团队之前的研究已经鉴定了DAL1作为一种保守的针叶树年龄生物标记基因,在油松从营养生长到生殖生长的时相转变过程中起重要作用。为了进一步理解年龄效应如何驱动针叶树的发育,阐明与DAL1相关的蛋白互作网络很关键。钮老师团队利用传统的Y2H筛选技术结合NGS测序技术,优化得到了Y2H-seq技术,与传统的筛选测序相比,大幅度节省了时间和实验成本。酵母文库价格
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